故事发生在4个小学生身上。这一天，他们被一片描述自己家乡的作文难住了。争论后，大家决定乘坐万能机器人布鲁变出的时光机，到远古参观旅游寻找灵感。可无奈卷入了一场外星人侵略原始部落的离奇事件中。最终4个小学生通力合作，成功的战胜了强大的外星人，帮助新结识的朋友小曼拯救了浓眉族原始部落。喜悦中大家发原始部落正是自己家乡的原型。就这样他们回到现代，经过这次大冒险，每个人都满意的写出了一片满是真心话的作文。

调查局机动组组长方国辉为人干练嫉恶如仇，与手下对周朝先经营的电玩场进行监拍时，拿到其经营地下赌场的证据，将其告上法庭，岂料法官被收买，周朝先被判无罪当庭释放。与黑金挂勾的侯部长暗中施压，调查局勒令方国辉休假，停止对周朝先的调查。周朝先为进一步控制台湾的政治，在记者会上公开声明要退党参选立法委员，欲与代表党竞选的黑帮老大丁宗树对着干。方国辉沮丧之际，得电视台女记者凌飞和法务部冯部长...

白人警探尼克．诺尔蒂为了追查神秘的毒贩"卖冰人"，不得不找当年的黑人罪犯搭档埃迪．墨菲协助提供线索。埃迪因有一笔巨款仍寄存在尼克手上，只好不情不愿地加以帮忙，但二人在合作过程中发生多起冲突。最后，他们还是发现了卖冰人"的真正身份，原来是警察中人。

抗日战争时期，一件出土的国宝——北魏古佛，震惊了上海滩三教九流，也引起了汉奸商人韩锡元的觊觎之心。警察局长余贵卿令特务处长沈剑中劫取古佛，此事引起江湖游侠江一剑、欧阳雄、等人的关注和警惕。在通往上海的轮船上，古佛被窃走，余局长下令抓来所有惯偷，知晓阿三将古佛卖给了古董店老板钱阿发，阿三被抓后，江一剑趁机混入余局长身边。通过对阿三的审问，沈剑中从钱阿发手中弄到了古佛，急于邀功的沈剑中在余府遇上韩锡元，韩一口咬定沈拿来的是赝品，余大怒，遂将沈关押起来。

埃塞俄比亚电影《羊羔》是一部处女作，讲述一个男孩和他的宠物羊被去城市里找工作的父亲寄养在亲戚家，勾勒出埃塞俄比亚乡村人民的生活状态。

John Stonemap教授任教于当地的大学，他做人的宗旨是不能用暴力解决一切的问题。有一天，他怀孕的妻子被街上的小阿飞袭击，John忍无可忍，竟错手杀死了他。这件事被一个专门非法播放拳击比赛的富翁知道，此后，阿John的生活便彻底改变了。富翁的手下抓住了阿John，并把他关在北极的一间小屋子里。比赛就在这里进行，因此阿John无法逃避。在他的第一轮比赛里，他不肯杀死他的对手，但为了妻子的生命，他会因此而改变生意吗？

John Stonemap教授任教于当地的大学，他做人的宗旨是不能用暴力解决一切的问题。有一天，他怀孕的妻子被街上的小阿飞袭击，John忍无可忍，竟错手杀死了他。这件事被一个专门非法播放拳击比赛的富翁知道，此后，阿John的生活便彻底改变了。富翁的手下抓住了阿John，并把他关在北极的一间小屋子里。比赛就在这里进行，因此阿John无法逃避。在他的第一轮比赛里，他不肯杀死他的对手，但为了妻子的生命，他会因此而改变生意吗？

柯南用新一的身份在电话不自愿地约会了小兰，陪她看5月3日的午夜场电影，以便请求小兰替他参加森谷帝二教授举办的茶会。柯南为此十分烦恼，不知如何掩饰他变小的事实。r柯南目送小兰离开后，为此烦恼的柯南接到一个电话，是来历不明的炸弹客挑战柯南！少年侦探团收到的引爆遥控飞机、被安装了炸弹的装小猫的篮子，还有环状线的的炸弹陷阱，大家奋力推理，才及时预防了可能发生的意外。可是，最后发现被安装了炸弹的其实是工藤新一和小兰的约会地点－米花町大楼！柯南该怎么办呢？.......

怪盗基德再度发出预告信，目标竟然是俄罗斯-罗曼诺夫王朝的皇室秘宝“记忆彩蛋”。柯南与服部联合保护“记忆彩蛋”，但把作案时间推理错误，令基德得逞，但基德于逃走中途被狙击。 自此引出一连串疑问，名侦探柯南，将于大阪解开一连串事件。

目暮警官、小兰的母亲妃英理、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑。

东京、神奈川、静冈、长野等地发生了六宗的杀人事件，由于现场留下了背面刻有字母的麻将牌，因而被认为是由同一案犯制造的广域连续杀人事件。警视厅联合各县警署召开联合搜查会议，毛利小五郎作为特别顾问而加入。事件中的有着诸如麻将牌的含义、第六名被害者死前遗言“七夕……今……”的含义、被害者的共同点、每名被害者都有一样物品被拿走等等谜团。会议结束后，柯南得知山村警官听到了某名警察用手机发送邮件时出现了类似《七之子》的按键声（即黑色组织头目的邮件地址），于是连忙追出，发现那名警察乘坐琴酒的车离去。

毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了！“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据犯人寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走，却完全找不到破解暗号的方法。另一方面，此时的江户川 柯南与灰原和少年侦探团一起，沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时，从兰打来的电话那里，柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实……

发生多起音乐家被暗杀的连续杀人事件。r被杀害的被害人，都是著名钢琴家所带领的音乐学院毕业生。r而他一手创立的音乐厅落成启用，首次特地举办音乐会特别邀请柯南一行人担任与会嘉宾。音乐会的焦点在于巴哈所弹奏的管风琴以及世界著名的小提琴“史特拉第瓦里”的音色，再加上具有绝对音感天才歌手的歌声。但是，就在音乐会活动日开始之前，陆续发生多起可疑事件。然而就在活动当天，柯南一行人所在的音乐会会场突然发生大爆炸。没多久，整个会场就被浓烈的火海所包围…。

第14弹围绕柯南和基德展开。大富豪铃木次郎吉向基德发出了挑战书，在飞往大阪的机上放了稀有宝石，他并未打算让基德得逞，柯南等人也一同被邀请前去。以天空为舞台的头脑风暴即将上演，《天空的遇难船》将呈现！r

有一天众多企业在米花市政大楼，共同进行了一种新的游戏“茧”的成果发表会。玩家可透过这个游戏，进入虚拟世界中，体验实地游玩游戏的快感。r但是在这个同时，汤玛斯辛多拉董事长基于某些动机，杀害了工藤优作的朋友樫村忠彬，后来被揭发罪行。r在另外一边正式启动的“茧”，被泽田弘树所开发的诺亚方舟程式入侵，使整个游戏变成了一场生存游戏。眼看着未出局的人数越来越少，柯南如何挽救50个人的性命呢？......

一个女人来到小五郎处，请其帮助看守宝石。这女人名叫牧树里，是代表着日本的女演员。她收到预告称有人将会去夺取她所拥有的宝石“命运的宝石”，而预告者正是怪盗基德。小五郎断言：基德将会在树里担任主角的传统话剧的公演最后一天前来盗宝。于是第二天，柯南，小五郎，小兰还有少年侦探团一起前往传统话剧公演的东京汐留。柯南对小五郎的推理充满疑问，于是自己推理基德的出现。然而，在那里出现的竟是工藤新一！

黄飞鸿，十三姨和鬼脚七三人远赴美国旧金山，只因一年前牙擦苏在美国开设宝芝林至今终于扎下了脚跟。黄飞鸿于路搭救了落难的美国快枪手比利，不想他们的旅队被林中埋伏的印第安人冲散，黄飞鸿为救十三姨落入湍急河流，头部受撞击后下落不明。十三姨和鬼脚七被人救起送至宝芝林，牙擦苏得见二人大喜过望，为这华工颇受镇长欺侮的小镇生活增添了生机。比利因出众的枪法受雇为助理治安官，对华人颇有好感的比利凭一...

一次大地震令洛杉矶地底深处的火山喷发。一时之间，城市一隅充满了地底爆发的岩浆。危机处理中心总指挥麦克采取了艾美博士的建议开始疏散人群，他们先利用数百万吨空中降水来使来势汹汹的岩浆变成障碍物，阻挡了岩浆的流动。正当大家以为松一口气时，艾美博士认为岩浆并没有真正被阻挡，只是改变了流向，而且正在往充满伤员的医院奔涌。他们只剩下30分钟的时间去处理这个问题，他们能成功吗？

重案组高级警察包伟雄因开枪打死人陷入深深的负罪感之中。前土木工程师麦坤因赌马失败失去一切，放手一搏准备其惊天大案。但不想一开始就因为杀人嫌疑被包伟雄关进大牢。本以为案件就此结束，麦坤的同伙竟公然在运送麦坤的途中截车救人！案情突然变得复杂，麦坤家中藏有大量炸药原料，包伟雄推断麦坤要抢劫金库。但香港金库之多，麦坤的目标到底是哪里？时间一分一秒的过去，陷入窘境的包伟雄，走投无路的麦坤，谁将在今夜成功达成自己的目标？

专针对警察的连续杀人案件发生了，警察内部引起巨大的回响。对于想得到案件情报的小五郎，目暮警部却意外地守口如瓶。看到如此情况的柯南，联想到事情可能和警察部有莫大的关系。然后，下一个被枪击的目标居然是佐藤刑警!刚巧在案发现埸出现的小兰受到案件的刺激而被弄至失忆!犯人为了杀人灭口，于是企图把唯一的目击证人杀害!深知情况严重的柯南，为了保护小兰，不惜孤身犯险去把犯人找出来!